La «Archicofradía de la Real Celeste y Militar Orden de Nuestra Señora de la Merced» se funda en Santander el día 4 de mayo de 1942, siendo la primera Cofradía de Ex-Cautivos de la Guerra Civil que surge en España. Su primitivo Reglamento se reforma y organiza adecuadamente el 25 de abril de 1945 y la Junta de Gobierno, en sesión celebrada el 11 de mayo del mismo año, nombra por unanimidad Socio de Honor al Obispo de la Diócesis, monseñor Eguino y Trecu, al mismo tiempo que confiere la dignidad de Hermano Abad Honorario al Gobernador Civil, don Joaquín Reguera Sevilla, en agradecimiento a su constante colaboración con la Hermandad.

Con motivo de la concesión del título de Archicofradía, agregada a la Matriz de Roma, la asociación introduce modificaciones a su reglamento en 1949, aprobadas por el Capítulo General el día 15 de febrero y por el Obispo de la Diócesis el 18. Desde entonces ostenta la denominación actual de «Archicofradía de la Celeste, Real y Militar Orden de Nuestra Señora de la Merced». Al sustituirse la designación de Hermano Abad por la de Hermano Mayor en esta modificación, ya figura como Hermano Mayor de la Asociación el Jefe del Estado, don Francisco Franco Bahamonde, pasando a ostentar don Joaquín Reguera la designación de ViceHermano Mayor.

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