El sector industrial principal de Sant Joan es la construcción, debido a la gran expansión urbanística del término, la comercialización del agro y las ramas de alimentación, servicios, madera y talleres mecánicos complementan un sector que en Sant Joan tradicionalmente ha estado formado por pequeñas empresas familiares que aún hoy existen. El comercio se ha desarrollado enormemente en los últimos años, cambiando la fisonomía comercial de Sant Joan, que tradicionalmente se componía de comercios de pequeñas dimensiones, creándose una importante red comercial de grandes superficies, ocupando estas nuevas empresas, casi por completo, las dos márgenes de la, carretera nacional de Alicante a Valencia, en todo su trayecto por el término de Sant Joan. La agricultura desde hace unos años ha pasado a un segundo plano, en favor del desarrollo urbanístico que cada vez absorbe más terreno del término municipal. Aunque todavía superviven cultivos como son: el limonero, almendro, algarrobo y naranjo.