Hijo de Paco Rabal y de la también actriz Asunción Balaguer. Es hijo del actor Liberto Rabal. Nacido en el seno de una familia dedicada al espectáculo, Benito Rabal trabajó como actor infantil en diversos filmes. Después pasó a formar parte de varios grupos de rock y jazz y publicó un libro titulado Notas del sur (1998).

Desde finales de los 70 hasta mediados de los 80 trabajó como ayudante de dirección de José Luis Garci, Imanol Uribe, Mario Camus, Miguel Hermoso y Jaime Chávarri.

Entre 1985 y 1986 realizó para TVE la serie de televisión ¿Qué pintamos aquí?, en la que su padre formó parte del reparto. En 1986 dirigió también su primer largometraje, El hermano bastardo de Dios, en cuyo guión colaboró el humorista José Luis Coll (1931–2007). Sus padres formaron parte del reparto.

En 1990 viajó a Cuba para dirigir la serie televisiva Nazca y, en 1992, un documental sobre su progenitor titulado Paco, mi padre. Dos años después realiza junto a Joaquín Luis Romero Marchent y José Antonio Páramo una nueva versión de la serie Curro Jiménez (1994), en la que repitieron interpretación Sancho Gracia (Curro Jiménez) y Álvaro de Luna (Algarrobo). La historia del bandolero andaluz había sido plasmada en la pequeña pantalla por Camus, Pilar Miró, Antonio Drove, Francisco Rovira Beleta y Rafael Romero Marchent en el año 1976.

Su padre volvió a protagonizar su siguiente trabajo. En este caso, fue la serie cómica para televisión De tal Paco, tal astilla (1997).

En 2002 volvió al cine para estrenar el largometraje El furgón, una comedia cuyo papel protagonista escribió expresamente para ser interpretado por su padre, que falleció meses antes de comenzar el rodaje. Al final, ese papel representado por Sancho Gracia, a quién acompañaron en el reparto Pablo Carbonell y Carlos Fuentes. Los tres interpretan a unos delincuentes de poca monta que logran escapar del furgón que les lleva a la cárcel. En el filme también actúan Óscar Ladoire y Elsa Pataky.